Multe dintre activitățile Fundației Dacica să desfășoară în parteneriat cu instituții de învățământ, institute și centre de cercetare, organe ale administrației publice locale și alte entități cu care Fundația a încheiat protocoale de colaborare ce vizează participarea la proiecte și programe comune de cercetare, susținerea reciprocă în organizarea acțiunilor de cercetare, protejarea și promovarea patrimoniului, colaborarea în scop didactic și științific în domeniul patrimoniului istoric și arheologic.
